Archiv shromažďuje veškeré dokumenty vznikající z činnosti instituce.Obsahuje nálezové zprávy a hlášení o výzkumech od roku 1953, kopie či přepisy většiny dokumentace z pracovní oblasti severočeských muzeí včetně deníku, inventárních a přírůstkových knih, kartoték atd.
Najdete zde také informace o nálezech z oblastí uložených mimo region. Dále jsou zde uloženy negativy i diapozitivy fotografické dokumentace z výzkumu i některých deponovaných předmětů. Samostatnou složkou je archiv leteckých snímků s příslušnou databází.